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英國ARIA項(xiàng)目主任伊萬啟動(dòng)5000萬英鎊的“通用制造器”項(xiàng)目,面向全球征集團(tuán)隊(duì),探索用蛋白質(zhì)實(shí)現(xiàn)分子級精度規(guī)模化制造新材料。 ## 1. 項(xiàng)目背景與核心愿景 當(dāng)前全球物理世界仍以依靠高溫高壓蠻力工藝生產(chǎn)的傳統(tǒng)材料為主,導(dǎo)致供應(yīng)鏈脆弱、資源沖突,大量理想性能的材料仍無法合成。蛋白質(zhì)具備實(shí)現(xiàn)分子級精度制造的獨(dú)特工具屬性,但現(xiàn)有投資和應(yīng)用多集中在制藥、生物催化領(lǐng)域,材料組裝潛力未被開發(fā),本項(xiàng)目計(jì)劃推動(dòng)蛋白質(zhì)成為制造電子、能源、基礎(chǔ)設(shè)施等領(lǐng)域下一代材料的“通用制造器”,類比半導(dǎo)體芯片晶圓廠但覆蓋更廣材料領(lǐng)域,改用蛋白質(zhì)替代極端加工條件。 ## 2. 項(xiàng)目為何選擇前沿研究承包商(FRC) 前沿研究承包商適合承擔(dān)學(xué)術(shù)界工程負(fù)擔(dān)過重、跨學(xué)科要求過高、過于偏重應(yīng)用,且不符合風(fēng)投十年回報(bào)周期要求的前沿項(xiàng)目。少數(shù)頂尖跨學(xué)科學(xué)術(shù)實(shí)驗(yàn)室雖可承擔(dān)相關(guān)工作,但鳳毛麟角,且孵化企業(yè)受風(fēng)投約束,常被迫放棄宏大目標(biāo)轉(zhuǎn)向短期利基市場。FRC是技術(shù)效益最大化組織,以合同收入推動(dòng)科學(xué)工程突破,適合挑戰(zhàn)“不可能”的前沿任務(wù),本項(xiàng)目支持申請者依托項(xiàng)目資金成立全新FRC。 ## 3. 項(xiàng)目資金與重點(diǎn)資助方向 項(xiàng)目總資金為5000萬英鎊,將資助少于10個(gè)聚焦蛋白質(zhì)通用制造的團(tuán)隊(duì),項(xiàng)目分為兩大技術(shù)領(lǐng)域:TA1開發(fā)蛋白質(zhì)程序化材料制造平臺(tái),TA2聯(lián)合行業(yè)伙伴完成技術(shù)規(guī)?;糯蟆?核心資助方向之一是構(gòu)建完整能力的通用制造器FRC,理想團(tuán)隊(duì)需涵蓋蛋白質(zhì)工程師、復(fù)雜軟物質(zhì)專家、無機(jī)材料礦化專家、過程工程師,能快速完成從氨基酸序列到場輔助組裝的“設(shè)計(jì)-測試”迭代,項(xiàng)目也期待跨界創(chuàng)新方案填補(bǔ)生物學(xué)與固體物理、蛋白質(zhì)組裝設(shè)計(jì)與規(guī)模化制造之間的空白。 另一重點(diǎn)方向是規(guī)?;鞍踪|(zhì)快速生產(chǎn)FRC,目標(biāo)是實(shí)現(xiàn)任意蛋白質(zhì)序列一周內(nèi)完成大批量定制生產(chǎn),滿足項(xiàng)目從分子到材料的多輪迭代需求,該服務(wù)也可面向制藥、食品等領(lǐng)域獲得穩(wěn)定合同收入支撐長期研發(fā),計(jì)量學(xué)領(lǐng)域的相關(guān)FRC提案也在征集范圍內(nèi)。 ## 4. 項(xiàng)目發(fā)起與申請邀約 本項(xiàng)目隸屬于ARIA“制造豐饒”機(jī)遇領(lǐng)域,發(fā)起人伊萬曾身處材料與生物技術(shù)交叉領(lǐng)域,受困于學(xué)術(shù)和風(fēng)投體系的約束,ARIA為其提供了實(shí)現(xiàn)愿景的平臺(tái),本次項(xiàng)目也為同類研究者開辟新路徑,歡迎有愿景有落地路徑的團(tuán)隊(duì)投遞申請。
蛋白質(zhì)作為通用制造器:新的生命科學(xué)和物質(zhì)世界的豐饒
2026-06-02 18:28

蛋白質(zhì)作為通用制造器:新的生命科學(xué)和物質(zhì)世界的豐饒

本文來自微信公眾號: 范陽 ,編輯:范陽,作者:范陽


今天的文章是來自伊萬·賈亞普納(Ivan Jayapurna)的客座投稿。伊萬是英國高級研究與發(fā)明局(ARIA)的項(xiàng)目主任(PD)。本周,他主導(dǎo)啟動(dòng)了一項(xiàng)價(jià)值5000萬英鎊的項(xiàng)目—“通用制造器”(Universal Fabricators)。


伊萬的項(xiàng)目中包含一些極具先鋒突破研究組織影子(BBN-shaped)的工作。他相信,在那些極具雄心的申請者中,有些人可能會(huì)將他的項(xiàng)目提案征集視為創(chuàng)辦屬于自己先鋒突破研究組織的絕佳機(jī)會(huì)。如果你正是這樣的人,且有能力解決伊萬在下文中列出的問題,請聯(lián)系他。(欲了解更多關(guān)于“先鋒突破研究組織”的信息,請參見之前的這篇FreakTakes文章。)


范陽注:什么是BBNs這種新型應(yīng)用科研組織形式,可以參考這篇文章,中文翻譯我起了個(gè)名字叫做“先鋒突破研究組織”。


https://www.freaktakes.com/p/the-bbn-fund


附帶一些背景信息:供那些沒有看過我對ARIA創(chuàng)始CEO采訪的讀者參考:ARIA的項(xiàng)目主任有權(quán)根據(jù)項(xiàng)目需要,資助成立全新的研發(fā)機(jī)構(gòu)。最近一期FreakTakes文章中提到的Syntato組織就是一個(gè)典型案例。ARIA的"可編程植物"項(xiàng)目(Programmable Plants)需要有一個(gè)團(tuán)隊(duì)來開發(fā)轉(zhuǎn)基因作物編輯的工具(build tools to transgenically gene-edit crops),Syntato正是為了完成這一任務(wù)而成立的,其依托的就是與ARIA簽訂的合同。


注:An Applied Crop Genetics BBN


https://www.freaktakes.com/p/an-applied-crop-genetics-bbn



伊萬的項(xiàng)目可能也會(huì)提供類似的機(jī)遇。在我們的討論中,伊萬對這樣一個(gè)理念感到尤為興奮:在理想狀態(tài)下,BBN先鋒突破研究組織可以成為把技術(shù)效益最大化的公司(BBNs can be technology-maximizing firms)。我希望你們的提案中,能有幾個(gè)可以達(dá)到這一標(biāo)準(zhǔn)。


1960年,仙童半導(dǎo)體(Fairchild Semiconductor)的擴(kuò)散工藝區(qū)。人類精密制造的巔峰之作當(dāng)屬半導(dǎo)體行業(yè)。正如伊萬所言:“我們實(shí)際上是在嘗試建造一個(gè)芯片晶圓廠,但它面向的是更廣泛的材料領(lǐng)域—并且我們使用的是蛋白質(zhì),而非極端的高溫與激光(We’re effectively trying to build a chip fab,but for a much broader range of materials—and using proteins rather than extreme heat and lasers)?!眻D片來自計(jì)算機(jī)歷史博物館館藏,由國家半導(dǎo)體(National Semiconductor)提供。


補(bǔ)充兩點(diǎn)簡短的說明。


我最初打算將這一系列與先鋒突破研究組織相關(guān)的客座投稿做成周更系列。事實(shí)證明這過于宏大了。我有時(shí)確實(shí)容易心急,多包涵。接下來新的更新節(jié)奏將調(diào)整為每月兩到三篇。


在英國,許多人已經(jīng)開始將BBN先鋒突破研究組織稱為“前沿研究承包商”(Frontier Research Contractors,簡稱FRC)。伊萬在下文中便使用了這一術(shù)語。


通用制造器(Universal Fabricators)


作者:伊萬·賈亞普納(Ivan Jayapurna)


人類歷史的各個(gè)時(shí)代都是由新材料定義的:石器時(shí)代、青銅時(shí)代、鐵器時(shí)代。然而,從鋼鐵到光纖,這些定義了文明的材料改變世界,往往不是在其被發(fā)現(xiàn)的瞬間,而是在開發(fā)出使其廉價(jià)且量產(chǎn)的工藝之后。我們的物理世界依然被古老的材料(木材、混凝土)和陳舊的材料(鋼鐵、塑料)所主導(dǎo),而這些材料都是利用蠻力(高溫和高壓)制造出來的(built using brute-force heat and pressure)。對鐵器時(shí)代制造范式以及20世紀(jì)化學(xué)工程的持續(xù)依賴,讓我們深陷于脆弱的全球供應(yīng)鏈、資源沖突(resource conflicts),以及極其狹窄的材料設(shè)計(jì)空間之中(a tiny corner of the total possible materials design space)。盡管材料合成技術(shù)取得了長足進(jìn)步,但許多理想的電磁、熱學(xué)、光學(xué)和力學(xué)性能依然難以實(shí)現(xiàn)(many desired electromagnetic,thermal,optical,and mechanical properties remain inaccessible)。


實(shí)現(xiàn)分子級精度的規(guī)模化制造,對于獲得最頂尖的材料性能至關(guān)重要,而蛋白質(zhì)則代表著一套獨(dú)特而強(qiáng)大的工具包,能夠?qū)崿F(xiàn)這一目標(biāo)。然而,盡管蛋白質(zhì)工程領(lǐng)域近期取得了諸多突破(例如AlphaFold、從頭設(shè)計(jì)、定向進(jìn)化、非天然氨基酸、無細(xì)胞合成等),隨后的投資和應(yīng)用卻主要集中在制藥和生物催化(pharmaceuticals and biocatalysis)領(lǐng)域,使得蛋白質(zhì)在材料組裝方面的潛力遠(yuǎn)未得到充分探索。如今,大多數(shù)蛋白質(zhì)工程師只設(shè)計(jì)藥物和酶。如果這個(gè)項(xiàng)目成功,他們將設(shè)計(jì)出應(yīng)用于電子、能源、基礎(chǔ)設(shè)施等領(lǐng)域的下一代材料—而蛋白質(zhì)將成為“通用制造器”(universal fabricators)。


作為ARIA的項(xiàng)目主任,我自己并沒有實(shí)驗(yàn)室。我的職責(zé)是設(shè)計(jì)項(xiàng)目方案、遴選資助對象、并協(xié)調(diào)他們朝著項(xiàng)目的“北極星”技術(shù)愿景前進(jìn)。因此,項(xiàng)目的成功幾乎完全取決于受資助方——他們將致力于將蛋白質(zhì)開發(fā)成通用制造器。我需要那些渴望成為“通用制造器”的研究人員和實(shí)驗(yàn)室。這個(gè)目標(biāo)宏大、工程繁重、且具有高度跨學(xué)科性質(zhì)的項(xiàng)目,其大量工作很可能非常適合由“前沿研究承包商”(FRC)—也就是所謂的“先鋒突破研究組織”(BBN)—來承擔(dān)。


為什么選擇前沿研究承包商(FRC)


Why FRCs


正如Eric在之前一篇FreakTakes文章中所寫:


前沿研究承包機(jī)構(gòu)往往有著雄心勃勃的目標(biāo),這些目標(biāo)對于學(xué)術(shù)界來說工程負(fù)擔(dān)過重、跨學(xué)科要求過高或過于偏重應(yīng)用。同時(shí),它們關(guān)注的往往是那些不適合風(fēng)險(xiǎn)投資的市場—原因要么是(a)這些市場并非價(jià)值數(shù)十億美元的大市場,要么是(b)工作的經(jīng)濟(jì)影響可能極其巨大,但無法在風(fēng)投基金約10年的存續(xù)期內(nèi)實(shí)現(xiàn)回報(bào)。


當(dāng)然,也有極少數(shù)的學(xué)術(shù)研究團(tuán)隊(duì)能夠克服這些障礙。這些實(shí)驗(yàn)室通常資金充足、高度跨學(xué)科,并且此前與ARPA風(fēng)格的機(jī)構(gòu)(如DARPA、ARPA-H等)有過合作經(jīng)歷。這些實(shí)驗(yàn)室擁有孵化公司的文化,從而能將研發(fā)工作合理分配—主實(shí)驗(yàn)室專注于基礎(chǔ)科學(xué)研究,而孵化出的公司則承擔(dān)更多“重工程”或“以用戶/產(chǎn)品為中心”的工作(These labs have a culture of spinning out companies,allowing for R&D to be distributed between basic scientific research in the main lab and more“engineering-heavy”or“user/product-focused”work in spinouts)。然而,這樣的實(shí)驗(yàn)室鳳毛麟角。即便存在,它們孵化出的公司也往往要受制于風(fēng)險(xiǎn)投資的約束。


例如,一個(gè)屢見不鮮的故事是:一家令人興奮的材料初創(chuàng)公司,懷揣著構(gòu)建革命性平臺(tái)技術(shù)的夢想,卻在市場和投資者利益的驅(qū)動(dòng)下,被迫走向制藥行業(yè)的利基市場(niche market),或者只能對現(xiàn)有系統(tǒng)進(jìn)行漸進(jìn)式的改良。這些工作固然都有用,但往往無法實(shí)現(xiàn)創(chuàng)始人最初的雄心壯志。對于追求利潤最大化的公司來說,這完全是可以理解的,但一旦你將技術(shù)范圍縮小到僅那些符合風(fēng)投約束條件的市場,許多從社會(huì)意義上令人振奮的技術(shù)探索方向就會(huì)因此喪失。


在我看來,前沿研究承包商(FRC)是技術(shù)效益最大化的組織(technology-maximising organizations)。它們向客戶尋求合同收入,不是僅僅將其作為追求的最大化目標(biāo),而是將其視作推動(dòng)“科學(xué)與工程雙重突破”的燃料(as fuel to develop coupled science-engineering breakthroughs)。這些團(tuán)隊(duì)?wèi)?yīng)當(dāng)致力于挑戰(zhàn)那些看似不可能的工作(seek to do work at the edge of the impossible)。正因如此,類似FRC的組織非常適合我們這樣的項(xiàng)目。


“通用制造器”前沿研究承包商


Universal Fabricator FRCs


我們5000萬英鎊項(xiàng)目的大部分資金,將用于資助少數(shù)幾個(gè)(少于10個(gè))將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)化為通用制造器的團(tuán)隊(duì)。關(guān)于一個(gè)能夠成功構(gòu)建出通用制造器的前沿研究承包商(FRC)應(yīng)該長什么樣,存在著多種不同的設(shè)想。其中一種形態(tài),可能是由具備以下典型背景的人才所組成的團(tuán)隊(duì):


1.蛋白質(zhì)工程師(Protein Engineer)—在分子尺度上設(shè)計(jì)構(gòu)建塊(building blocks)及其相互作用。


2.復(fù)雜軟物質(zhì)專家(Complex Soft Matter Expert)—調(diào)控構(gòu)建塊之間的短程和長程相互作用,使其能夠在正確的長度尺度和時(shí)間尺度上進(jìn)行組裝。


3.無機(jī)材料礦化專家(Inorganic Materials Mineralization Expert)—編程控制無機(jī)物質(zhì)的成核與生長,使其結(jié)晶或結(jié)成非晶態(tài),從而轉(zhuǎn)化為極具價(jià)值的功能材料。


4.過程(工藝)工程師(Process Engineer)—設(shè)計(jì)反應(yīng)環(huán)境,構(gòu)建“錯(cuò)誤自校正”的組裝系統(tǒng),通過施加場和流體動(dòng)力學(xué)對組裝過程產(chǎn)生選擇壓(impose selective pressures for assembly through fields and flows)。


無論這些團(tuán)隊(duì)如何構(gòu)建和組成,他們都應(yīng)能夠快速迭代“設(shè)計(jì)—測試”循環(huán)—從氨基酸序列出發(fā),迅速推進(jìn)到單分子設(shè)計(jì),再到體系設(shè)計(jì),再到場/流體輔助下的組裝(液體→漿料→固體)(liquid→slurry→solid)。


需要進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)的是,這個(gè)全明星團(tuán)隊(duì)配置只是(我本人)對如何構(gòu)建一個(gè)通用制造器型FRC的一種設(shè)想。我們正在尋找富有創(chuàng)造力的人,希望他們對團(tuán)隊(duì)構(gòu)成有自己的見解,能夠以超出我們預(yù)期的想象力來填補(bǔ)以下領(lǐng)域之間的空白:


1.生物學(xué)與固體物理學(xué)之間(Biology and solid-state physics)


2.蛋白質(zhì)組裝+模板化礦化(序列→結(jié)構(gòu)→功能)與可規(guī)?;牧现圃欤庸ぁY(jié)構(gòu)→性能)之間


(Protein assembly+templated mineralisation(sequence→structure→function)and scalable materials manufacturing(processing→structure→performance))


如果成功,我希望這些通用制造器能夠完成定義人類下一個(gè)歷史時(shí)代的工作。我期待讀到任何有長遠(yuǎn)愿景、也有實(shí)現(xiàn)路徑的團(tuán)隊(duì)所提交的方案。


蛋白質(zhì)生產(chǎn)型FRC及其他


Protein Production FRCs and Beyond


除了構(gòu)建由蛋白質(zhì)編程的制造平臺(tái)團(tuán)隊(duì)之外,本項(xiàng)目可能還會(huì)受益于其他具備前沿研究承包商(FRC)特質(zhì)的團(tuán)隊(duì)。我們需要解決的一個(gè)巨大挑戰(zhàn),是如何擴(kuò)大“蛋白質(zhì)序列到功能”的“設(shè)計(jì)-測試”循環(huán)規(guī)模(scaling up protein sequence-to-function design-test cycles)。如今,在分子尺度上進(jìn)行計(jì)算機(jī)模擬篩選和自動(dòng)化分析已經(jīng)可以高效完成。但如果要在現(xiàn)有的基礎(chǔ)上,將這一規(guī)模擴(kuò)大好幾個(gè)數(shù)量級以達(dá)到材料尺度,樂觀估計(jì)目前也需要數(shù)月時(shí)間。理想情況下,我們希望將這一時(shí)間縮短到一周以內(nèi),以匹配目前藥物設(shè)計(jì)管線中的最前沿水平。


一個(gè)專注于推進(jìn)快速交付—即大批量、定制化、工程化蛋白質(zhì)生產(chǎn)的前沿研究承包商(FRC),很可能會(huì)成為我們項(xiàng)目最重要的供應(yīng)商之一。具體而言,我正在尋找這樣一個(gè)團(tuán)隊(duì),他們能夠開發(fā)出一種系統(tǒng):如果我給你一段任意的蛋白質(zhì)序列,你能夠在一周內(nèi)交給我足夠的材料,去例如模板化組裝出一塊大到足以測量其最大磁能積((BH)max)的磁體。


目前,這項(xiàng)工作可能還需要依賴生命系統(tǒng)來完成,但可以想象,通過大幅改進(jìn)的非生命生產(chǎn)系統(tǒng)(例如無細(xì)胞系統(tǒng)、蛋白質(zhì)打印機(jī))也能實(shí)現(xiàn)。如果一個(gè)團(tuán)隊(duì)有能力并且有志于顯著提升該領(lǐng)域的技術(shù)水平,那么它就是我們有可能扶持創(chuàng)立的一個(gè)寶貴組織。


我們預(yù)計(jì),這種服務(wù)除了滿足我們這個(gè)材料科學(xué)項(xiàng)目的需求和周期之外,對各種其他客戶也會(huì)極其有用。在短期內(nèi),我們預(yù)計(jì),從制藥、生物催化劑到食品、纖維和包裝等市場,也能獲得可持續(xù)的合同收入。這些合同,加上我們項(xiàng)目自身的大量需求,將能夠提供穩(wěn)定的資金,用于攻克技術(shù)障礙,從而追求該領(lǐng)域雄心勃勃的長期目標(biāo)。


這僅僅是符合我項(xiàng)目需求的兩種可能的FRC示例。我非常期待讀到你們提出更多此類方案的申請。例如,在計(jì)量學(xué)等領(lǐng)域的FRC提案將尤其受歡迎。是否存在一個(gè)具備FRC特質(zhì)的團(tuán)隊(duì),能夠快速測量出蛋白質(zhì)在宏觀結(jié)構(gòu)中無缺陷嵌入的精細(xì)情況(Is there an FRC-shaped group that could quickly measure defect-free incorporation of proteins into macroscopic structures)?


冒險(xiǎn)召喚


Call To Adventure


在加入ARIA之前,我是一名困在材料與生物技術(shù)交叉領(lǐng)域的研究者—既是生物技術(shù)孵化器中唯一一家非醫(yī)療健康類公司,又是氣候加速器中唯一一個(gè)生物技術(shù)項(xiàng)目—同時(shí)還被夾在學(xué)術(shù)界與利潤最大化的初創(chuàng)公司之間。而ARIA為我提供了一條更直接的替代路徑,去實(shí)現(xiàn)我“制造豐饒”(Manufacturing Abundance)的北極星愿景。通過“通用制造器”這一項(xiàng)目,我希望為其他人也開辟出不同的路徑。如果這篇文章引起了你的共鳴,那就讓我們一起踏上這段旅程吧。



參考信息:


來自ARIA網(wǎng)站上的介紹:


https://aria.org.uk/opportunity-spaces/manufacturing-abundance/universal-fabricators/


通用制造器


Universal Fabricators


在5000萬英鎊資金的支持下,該項(xiàng)目隸屬于“制造豐饒”(Manufacturing Abundance)這一機(jī)遇領(lǐng)域,旨在利用蛋白質(zhì)來規(guī)模化生產(chǎn)具有功能通用性的各種材料。


技術(shù)領(lǐng)域


Technical Areas


本項(xiàng)目分為兩個(gè)技術(shù)領(lǐng)域(TA),每個(gè)領(lǐng)域均有各自明確的目標(biāo)。


技術(shù)領(lǐng)域一(TA1):蛋白質(zhì)程序化材料制造平臺(tái)


專注于解決工程難題,以解鎖可編程制造平臺(tái)技術(shù)。


技術(shù)領(lǐng)域二(TA2):規(guī)?;糯?/p>


基于技術(shù)領(lǐng)域一的成果,各團(tuán)隊(duì)將與行業(yè)合作伙伴協(xié)作,根據(jù)具體的應(yīng)用需求對其技術(shù)路線進(jìn)行規(guī)?;糯蟆?/p>



原文鏈接:


https://substack.com/home/post/p-188179441

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